Le firme del DNA batterico nel sangue aprono la strada ad un nuovo ed universale test per la diagnosi del cancro

Il cancro è classicamente considerato una malattia del genoma umano. Tuttavia, studi recenti hanno dimostrato che il microbioma contribuisce in modo sostanziale ad alcuni tipi di cancro; in particolare, i contributi del microbioma fecale ai tumori gastrointestinali. La caratterizzazione sistematica del microbioma del cancro offre l’opportunità di sviluppare tecniche che sfruttano molecole non umane derivate da microrganismi nella diagnosi di una grave malattia umana. In seguito a recenti dimostrazioni secondo cui alcuni tipi di tumore mostrano sostanziali contributi microbici, i ricercatori della UC San Diego hanno inizialmente esaminato 18.116 campioni di 33 tipi di tumore ottenuti da pazienti non trattati ottenuti dal The Cancer Genome Atlas (TCGA) per determinare la presenza di DNA microbico ed hanno trovato delle “firme” microbiche uniche nel tessuto e nel sangue all’interno e tra la maggior parte dei principali tipi di tumore. Queste “firme” o “tracce” nel sangue del TCGA sono rimaste predittive quando venivano applicate a pazienti con carcinoma in stadio Ia-IIc e tumori privi di alterazioni genomiche attualmente misurate su due piattaforme, presenti in commercio, per l’individuazione del DNA tumorale circolante, nonostante l’uso di sistemi di decontaminazione molto rigorosi che arrivavano a scartare fino al 92,3% dei dati della sequenza totale. Inoltre, questo approccio era in grado di discriminare i campioni di individui sani e senza un cancro (n = 69) e quelli ottenuti da pazienti con diversi tipi di cancro (della prostata, del polmone ed il melanoma per un totale di 100 campioni) utilizzando esclusivamente cellule di derivazione plasmatica, acidi nucleici microbici liberi. Gli Autori sono convinti che questo potenziale strumento diagnostico in ambito oncologico, ma basato sul microbioma meriti ulteriori indagini in quanto apre la prospettiva che nei campioni di sangue possano essere rilevate firme di DNA microbico uniche che possono non solo identificare numerosi carcinomi ma anche individuarli nelle fasi iniziali con l’impiego di un semplice prelievo di sangue.