Nel microbioma umano sono presenti un numero straordinario di geni

Come ripetutamente rilevato, il microbioma umano, che fa riferimento al patrimonio genetico del microbiota, costituito dai microrganismi presenti nel nostro corpo (intestino, stomaco, cute, cavità orale, vagina) è oggetto di costante e crescente interesse. Nonostante questo interesse sostanziale per la diversità delle specie del microbioma umano e il suo ruolo nelle malattie, la dimensione della sua diversità genetica, che è fondamentale per decifrare le interazioni uomo-microbo, non è stata quantificata. Un team di ricercatori statunitensi sta realizzando un progetto finalizzato a catalogare tutti i geni nel microbioma umano collettivo. Nel primo studio pubblicato del team sono stati segnalati 46 milioni di geni da soli 3.500 campioni di microbiomi umani.
Gli Autori hanno condotto una meta-analisi incrociata dei metagenomi da due sedi del corpo umano, la bocca e l’intestino, ottenendo 3.655 campioni di 13 studi. Hanno così potuto rilevare un’incredibile eterogeneità genetica nel set di dati, identificando un totale di 45.666.334 geni non ridondanti (23.961.508 dal cavo orale e 22.254.436 dall’intestino) al livello del 95% di identità. Il cinquanta percento di tutti i geni erano “singleton” o unici per un singolo campione metagenomico. Questi geni altamente specifici sembrano svolgere funzioni specializzate e derivano da ceppi microbici specifici della sub-popolazione. Nel complesso, questi risultati forniscono un supporto per l’inspiegabile eterogeneità osservata nei fenotipi derivati dal microbioma nell’uomo. Sulla base di questi dati preliminari gli Autori hanno creato una risorsa, a cui è possibile accedere all’indirizzo https://microbial-genes.bio.